Dans la sombre ville souterraine de Lux, les gens vivent dans la peur et le désespoir sous le règne de diverses factions criminelles. Presque isolée de la surface, la seule interaction des gangs avec le monde extérieur est leur exploitation minière de « raphia », qui est la raison d’être de la ville.
Disponible uniquement en Lux, cette substance rare est à la base des greffes “texhnolyze” qui permettent aux humains de remplacer des parties de leur corps par des prothèses cybernétiques. Ces derniers ont la particularité de ne pas déclencher de réponse immunitaire chez leurs hôtes et la “Classe” a le privilège de mener des recherches sur eux. Cette organisation insaisissable, également en charge de la production de raphia,
Le fragile équilibre des pouvoirs à Lux est perturbé lorsqu’un mystérieux visiteur nommé Kazuho Yoshii commence à commettre une série de crimes qui mettent les gangs à la gorge. Au milieu du chaos, de nouveaux acteurs émergent : Ichise, un ex-boxeur mutilé par Organo et récemment texhnolysé par Eriko “Doc” Kamata ; et Ran, un jeune fleuriste qui voit l’avenir. Alors que Lux plonge régulièrement dans la folie, Ichise et Ran se retrouvent impliqués dans la plus grande crise à laquelle la ville ait jamais été confrontée.