Shinichi Kudou, un lycéen au talent étonnant dans le travail de détective, est bien connu pour avoir résolu plusieurs cas difficiles. Un jour, alors que Shinichi repère deux hommes suspects et décide de les suivre, il devient par inadvertance le témoin d’une activité illégale inquiétante. Malheureusement, il est pris en flagrant délit, alors les hommes lui administrent une drogue expérimentale formulée par leur organisation criminelle, le laissant à sa mort. Cependant, à son grand étonnement, Shinichi vit pour voir un autre jour, mais maintenant dans le corps d’un enfant de sept ans.
Préservant parfaitement son intelligence originelle, il cache sa véritable identité à tout le monde, y compris à son ami d’enfance Ran Mouri et à son père, le détective privé Kogorou Mouri. À cette fin, il prend le pseudonyme de Conan Edogawa, inspiré par les écrivains mystérieux Arthur Conan Doyle et Ranpo Edogawa
