L’histoire d’Another se déroule 26 ans après un évènement tragique, provoquant une malédiction encore présente: un élève de la classe 3-3 est mort mais ses camarades et professeurs ont continué comme si cet élève était toujours présent. À présent, chaque mois, il y a au moins un mort dans la ville de Yomiyama mais cela ne se reproduit pas forcément à chaque année.
Nous suivons alors Koichi Sakakibara, un nouvel élève qui a été transféré dans cette fameuse classe. Il sera intrigué par l’ambiance pesante dans la classe et sa curiosité sera éveillée par une fille au nom de Mei Misaki, une adolescente calme et mystérieuse.
