Japon, 1988. Une explosion provoquée par un jeune garçon doté de pouvoirs psychiques déchire la ville de Tokyo et allume la mèche qui mène à la Troisième Guerre mondiale. Afin d’empêcher toute nouvelle destruction, il est capturé et placé en garde à vue, pour ne plus jamais être entendu. Maintenant, en 2019, une version restaurée de la ville connue sous le nom de Neo-Tokyo – une zone en proie à la violence des gangs et au terrorisme contre le gouvernement actuel – se tient à sa place. Ici, Shoutarou Kaneda dirige “les Capsules”, un groupe d’inadaptés connus pour conduire de grosses motos personnalisées et être en conflit constant avec leurs rivaux “les Clowns”.
Au cours d’une de ces batailles, le meilleur ami de Shoutarou, Tetsuo Shima, est pris dans un accident avec un esper qui se retrouve dans les rues de Tokyo après avoir échappé au confinement d’une institution gouvernementale. Grâce à cette rencontre, Tetsuo commence à développer ses propres capacités mystérieuses, alors que le gouvernement cherche à mettre en quarantaine ce dernier médium dans une tentative désespérée de l’empêcher de libérer le pouvoir destructeur qui pourrait à nouveau mettre la ville à genoux.
